CHAPTER ONE                                                                                                                    1

1.1       Introduction                                                                                                                1

1.2       Aquaculture                                                                                                                3

1.3       Diversity                                                                                                                     7

CHAPTER TWO                                                                                                                    8

2.1       Probiotic in Aquaculture                                                                                             8

2.2       State of Arts and Challenges in Aquaculture                                                             11

2.3       Microbes as Tools for Water Management                                                                 12

2.3.1    Bacteria                                                                                                                       14

2.3.2    Fungi                                                                                                                           15

2.3.3    Microalgae                                                                                                                  15

2.3.4    Zooplankton                                                                                                                18

CHAPTER THREE                                                                                                                21

3.1       Monitoring and Managing Microbes in Aquaculture                                                  21

3.2       Significance of Microorganism in Improving Water Quality and Animal Health in Aquaculture                                                                                                                22

3.2.1    Directing microbial communities                                                                                24

3.2.2    Recirculating aquaculture systems                                                                              26

CHAPTER FOUR                                                                                                                  29

4.1       Effects of Aquaculture Activities and Microbial Assembly                                       29

4.2       Importance of Microbial Communities in Aquaculture                                              31

4.3       Application of Biofloc (BFT) Technology in Aquaculture                                         32

CHAPTER FIVE: CONCLUSION                                                                                       34

References                                                                                                                              36